Пирролизин
Пирролизин · Близкие статьи · Примечания · Внешние Официальный сайт ·
| Пирролизин | |
 | |
 | |
| Общие | |
|---|---|
| Хим. формула | C12H21N3O3 |
| Физические свойства | |
| Молярная масса | 255,313 г/моль |
| Классификация | |
| Рег. номер CAS | |
| PubChem | |
| SMILES |
|
| ChemSpider | |
| Приводятся данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иначе. | |
Пирролизин — это природная аминокислота, кодируемая генами некоторых метаногенных архей. Пирролизин входит в состав некоторых ферментов метаболизма метана.
Пирролизин является производным аминокислоты лизина и кодируется кодоном UAG (обычно 'amber' стоп-кодоном). Возможно, модифицируется в случае наличия специфической последовательности нуклеотидов PYLIS, которая образует стебелек и петлю в структуре мРНК, усиливая включение пирролизина вместо терминации трансляции. Кодон UAG используется реже, чем другие стоп-кодоны, и, если встречается в открытой рамке считывания, за ним, обычно, следуют другие стоп-кодоны.
Рядом с кластером генов переноса метильной группы археи Methanosarcina barkeri располагается ген pylT, который кодирует необычную тРНК с антикодоном CUA. Соседний ген pylS кодирует аминоацил-тРНК-синтетазу второго класса, которая присоединяет пирролизин к тРНК-продукту гена pylT. Оперон, содержащий гены pylT и pylS также найден в геномах других секвенированных представителей семейства Methanosarcinaceae. Гомологи генов pylS и pylT обнаружены также в грам-положительной бактерии Desulfitobacterium hafniense, не смотря на то, что функции этих гомологов у данной бактерии неизвестны.
Первоначально было показано, что продукт гена pylT — тРНК с антикодоном (CUA), может быть «заряжена» аминокислотой лизином с помощью белка PylS. Относительно не так давно было показано, что тРНК с аниткодоном CUA может быть «заряжена» лизином в условиях in vitro последовательным взаимодействием с лизиновыми тРНК-синтетазами первого и второго класса из M. barkeri. Последние данные указывают на то, что происходит прямое присоединение пирролизина к тРНК с антикодоном CUA при помощи белкового продукта гена pylS. Это означает, что пирролизин представляет собой 22ую аминокислоту, закодированную генетически.
Для обозначения пирролизина ИЮПАК рекомендует трехбуквенное сокращение Pyl и однобуквенное O.