Каталог статей /

Пирролизин

Пирролизин · Близкие статьи · Примечания · Внешние Официальный сайт ·


Пирролизин
Пирролизин
Пирролизин
Общие
Хим. формула C12H21N3O3
Физические свойства
Молярная масса 255,313 г/моль
Классификация
Рег. номер CAS 448235-52-7
PubChem 5460671
SMILES

[C@@H(C(=O)O)N)[C@@H]1/N=C\C[C@H]1C O=C(NCCCC[C@@H](C(=O)O)N)[C@@H]1/N=C\C[C@H]1C]

ChemSpider 4574156
Приводятся данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иначе.

Пирролизин — это природная аминокислота, кодируемая генами некоторых метаногенных архей. Пирролизин входит в состав некоторых ферментов метаболизма метана.

Пирролизин является производным аминокислоты лизина и кодируется кодоном UAG (обычно 'amber' стоп-кодоном). Возможно, модифицируется в случае наличия специфической последовательности нуклеотидов PYLIS, которая образует стебелек и петлю в структуре мРНК, усиливая включение пирролизина вместо терминации трансляции. Кодон UAG используется реже, чем другие стоп-кодоны, и, если встречается в открытой рамке считывания, за ним, обычно, следуют другие стоп-кодоны.

Рядом с кластером генов переноса метильной группы археи Methanosarcina barkeri располагается ген pylT, который кодирует необычную тРНК с антикодоном CUA. Соседний ген pylS кодирует аминоацил-тРНК-синтетазу второго класса, которая присоединяет пирролизин к тРНК-продукту гена pylT. Оперон, содержащий гены pylT и pylS также найден в геномах других секвенированных представителей семейства Methanosarcinaceae. Гомологи генов pylS и pylT обнаружены также в грам-положительной бактерии Desulfitobacterium hafniense, не смотря на то, что функции этих гомологов у данной бактерии неизвестны.

Первоначально было показано, что продукт гена pylT — тРНК с антикодоном (CUA), может быть «заряжена» аминокислотой лизином с помощью белка PylS. Относительно не так давно было показано, что тРНК с аниткодоном CUA может быть «заряжена» лизином в условиях in vitro последовательным взаимодействием с лизиновыми тРНК-синтетазами первого и второго класса из M. barkeri. Последние данные указывают на то, что происходит прямое присоединение пирролизина к тРНК с антикодоном CUA при помощи белкового продукта гена pylS. Это означает, что пирролизин представляет собой 22ую аминокислоту, закодированную генетически.

Для обозначения пирролизина ИЮПАК рекомендует трехбуквенное сокращение Pyl и однобуквенное O.

  • Russian to English Russian to German Russian to French Russian to Spanish Russian to Italian Russian to Japanese

Часть информации на сайте получена из открытых источников. Основа ВикипедиЯ. | Пожалуйста, внимательно прочитайте эту страницу! |