Обмен веществ · Биологические молекулы · Катаболизм · Энергетические превращения · Анаболизм · Ксенобиотики и окислительный метаболизм · Термодинамика живых организмов · Регуляция и контроль · Эволюция · Методы исследования · История · Близкие статьи ·

Подробное рассмотрение темы: Филогенетика

Филогенетическое дерево показывает общее происхождение организмов во всех трёх доменах. Бактерии окрашены голубым, эукариоты — красным, и археи — зелёным. Взаимосвязанные позиции некоторых типов показаны вокруг дерева.

Главные пути метаболизма, описанные выше, к примеру, гликолиза и цикла Кребса, присутствуют у всех трёх доменах живых существ и обнаруживаются у последнего универсального общего предка. Этот универсальный предок был прокариотом и, вероятно, метаногеном с аминокислотным, нуклеотидным, углеводным и липидным метаболизмом. Сохранение этих древних метаболических путей в эволюции может быть результатом того, что эти реакции оптимальны для решения конкретных проблем с метаболизмом. Так, конечные продукты гликолиза и цикла Кребса образуются с высокой эффективностью и с минимальным количеством стадий. Первые метаболические пути на основе ферментов могли быть частями пуринового метаболизма нуклеотидов с предыдущим метаболических путей были частью древнего мира РНК.

Многие модели были предложены для описания механизмов, посредством которых новые метаболические пути эволюционировали. К ним относятся последовательное добавление новых ферментов на короткий предковый путь, дупликация, а после дивергенция всех путей, и кроме этого набор уже существующих ферментов и их сборка в новый путь реакций. Относительную важность этих механизмов неясна, в тоже время геномные исследования показали, что ферменты в метаболическом пути, скорее всего, имеют общее происхождение, предполагая, что многие пути эволюционировали шаг за шагом с новыми функциями, созданными из уже существующих этапов пути. Альтернативная модель основана на исследованиях, в которых прослеживается эволюция структуры белков в метаболических связях; предполагают, что ферменты собирались для выполнения схожих функций в разных метаболических путях Эти процессы сборки привели к эволюционированию ферментативной мозаики. Некоторые части обмена веществ возможно существовали в качестве «модулей», которые могли быть повторно использованы в разных путях для выполнения схожих функций.

Эволюция также может приводить к потере метаболических функций. К примеру, у некоторых паразитов метаболические процессы, которые не важны для выживания, утрачены и готовые аминокислоты, нуклеотиды и углеводы получаются от хозяина. Подобные упрощения метаболических возможностей наблюдают у эндосимбиотических организмов.